El microbioma humano es el total de microorganismos con su material genético que vive en un individuo. Asimismo, existen ecosistemas particulares en distintas regiones del organismo que originan un grupo específico de microorganismos llamado microbiota, en los últimos años investigaciones han reportado el rol de la microbiota oral asociado a la carcinogénesis. La microbiota oral unida a otros factores etiológicos tiene un papel crucial en el desarrollo de enfermedades crónicas como caries dental, enfermedad periodontal, lesiones premalignas de mucosa oral y alteraciones celulares degenerativas que llegan a provocar cáncer. Actualmente se utiliza la metagenómica para identificar la relación huésped-patógeno de bacterias de especies específicas entre las que se encuentran Porphyromo las gingivalis y Fusobacterium nucleatum, que junto con otras intervienen en el proceso de la carcinogénesis; este método facilita el conocimiento del mecanismo de acción que pueden inducir las bacterias para malignizar las células epiteliales de la cavidad oral. El objetivo de este estudio fue investigar evidencias en ensayos recientes que sugieren la correlación causal entre la microbiota oral y el carcinoma de células escamosas.